2005年按國家食品藥品監(jiān)督管理局的要求,公司投資巨資進(jìn)行GMP改造,引進(jìn)了一流的片劑、散劑、顆粒劑、丸劑、膠囊劑、膏劑、口服液等劑型的生產(chǎn)線，中草藥的提取濃縮生產(chǎn)線，中藥飲片生產(chǎn)線及藥妝生產(chǎn)線。2006年7月，全公司七個(gè)劑型一次性通過國家GMP認(rèn)證，開創(chuàng)了全國中成藥及保健食品行業(yè)GMP認(rèn)證之先河。技術(shù)改造，加快了企業(yè)科技發(fā)展步伐，使中成藥的技術(shù)含量得到提升。

山東皇菴堂藥業(yè)有限公司源于清朝光緒年間(公元1890年)，幾次險(xiǎn)毀于動(dòng)亂之中，民初皇菴堂老藥鋪正式更名為皇菴堂老藥鋪，藥品配方均出自祖?zhèn)髌娣健⑺纬�的和劑局方、明朝的金古方、清宮秘方以及民間驗(yàn)方等，其產(chǎn)品在1915年（民國四年）時(shí)，就曾代表國貨精品參加首屆“國際巴拿馬博覽會(huì)”，并獲金獎(jiǎng)，其產(chǎn)品并以“方名、料優(yōu)、工精”，而享譽(yù)海內(nèi)外。解放后皇菴堂老藥鋪重獲新生，1955年公私合營時(shí)更名為公私合營濟(jì)南皇菴堂老藥號(hào)，后因文革而關(guān)閉。1998年，后人，斥資2億于濟(jì)南市南部老運(yùn)河?xùn)|岸風(fēng)景優(yōu)美的濟(jì)寧市國家高新技術(shù)開發(fā)區(qū)生物醫(yī)藥園區(qū)內(nèi)組建山東皇菴堂藥業(yè)有限公司。